一个全抗体典型的分为Fv和Fc两个功能区，其中Fv用来帮定抗原，Fc用来帮定一些效应细胞上的受体，比如ADCC，CDC，提高抗体的半衰期。Fv又包括框架区（framework）和互补决定区（CDR），CDR又分1，2，3 三个区，framework分1，2，3，4 四个区。为抗体建模的目前有如下用处，1）抗体人源化，抗体人源化的实质就是把鼠抗上的和人体不兼容的氨基酸组合突变成人源的，突变的方法很多，关键是你怎么评估你的突变是对抗体的结构和功能没有巨大的影响，如果有抗体的3d模型，这个问题就可以解决了；2）亲和力成熟，基于抗体结构模型的亲和力成熟可以提高实验的针对性，简化实验步骤和时间。Rosetta是一个很著名的大分子建模软件，对抗体的建模Rosetta开发组也提供了Web服务器供大家使用，但是由于抗体建模的人越来越多，排队的时间也越来越长了，同时由于他们的网站使用了一些google的资源，对一些中国用户会出现一些异常。求人不如求已，今天就说说怎么用rosetta在本地服务器上建抗体模型。